• Научно-исследовательский
    вычислительный центр
    Московского государственного
    университета имени М. В. Ломоносова

    Иван Сергеевич Ильин защитил диссертацию

  • Иван Сергеевич Ильин пришел в НИВЦ в лабораторию 405 в ноябре 2016 года, будучи студентом дипломником Факультета фундаментальной медицины МГУ имени М.В. Ломоносова. Несмотря на сжатые сроки Иван Сергеевич успешно освоил методы молекулярного моделирования, в том числе программу докинга SOL, программу квантово-химических полуэмпирических методов MOPAC и ряд вспомогательных программ, позволяющих готовить белки-мишени и лиганды для моделирования и анализировать результаты докинга; он научился самостоятельно проводить докинг не только на рабочей станции, но и на суперкомпьютере МГУ Ломоносов-2 в многопроцессорном режиме, проводить виртуальный скрининг с помощью докинга и суперкомпьютера Ломоносов-2 больших баз данных готовых соединений с целью выявления молекул, наиболее сильно связывающихся с определенными областями заданных белков-мишеней. В 2017 году Иван Сергеевич после успешной защиты диплома по специальности «Фармация» поступил в очную аспирантуру Факультета фундаментальной медицины МГУ на кафедру Фармацевтической химии, фармакогнозии и организации фармацевтического дела и прошел успешно за 3 года обучение в аспирантуре, причем в последний год обучения в аспирантуре, 2020, получал повышенную стипендию аспиранта МГУ за научные достижения. Характерной особенностью Ивана Сергеевича является умение глубоко погружаться в новые научные проблемы и успешно решать их, умение работать в коллективе лаборатории, а также умение успешно работать с экспериментаторами для проверки полученных теоретических результатов. Иван Сергеевич 16 ноября 2020 года успешно защитил (24 – за, 0 – против, недействительных – нет) диссертацию на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.08 «Биоинженерия» на диссертационном совете МГУ.01.04 (Физический факультет МГУ, Председатель совета проф. Всеволод Александрович Твердислов). Тема диссертации посвящена применению методам компьютерного моделирования для разработки лекарств: «ПОИСК НОВЫХ ИНГИБИТОРОВ ДЛЯ ЗАДАННЫХ БЕЛКОВ-МИШЕНЕЙ МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ». Цель работы: поиск ингибиторов, влияющих на работу трех терапевтических белков-мишеней: фактор Ха (для нового класса антикоагулянтов), β-лактамаза TEM-1(для борьбы с резистентностью бактерий к антибиотикам), белок YB-1 (разработка нового класса противоопухолевых лекарств).